어란 DNA 바코드 기반 한반도 연근해 주요 어류의 산란장 지도 작성
- Title
- 어란 DNA 바코드 기반 한반도 연근해 주요 어류의 산란장 지도 작성
- Principal Investigator
- 김성
- KIOST Author(s)
- Kim, Sung(김성); Jang, Yo Soon(장요순); Yang, Eun Chan(양은찬); Cho, Hong Yeon(조홍연); Choi, Jae Ho(최재호); Kim, Choong Gon(김충곤)
- Alternative Author(s)
- 김성; 장요순; 양은찬; 김재현; 조홍연; 최재호; DayuWiyati; 김충곤
- Abstract
- ○ 한반도 연근해 혼합어란 high-throughput sequencing(HTS) 원시자료 864건 137GB 수집
- 2012 - 2020년 한반도 연근해 및 하구역(한국해양과학기술원, 해양환경공단 등)
○ 혼합어란 HTS 원시자료 분석을 위한 COX1 reference library(종 동정 기준) 제작
- NCBI/GenBank, BOLD 등에서 DNA 바코드 염기서열 추출
- 중복염기서열 제거 및 정렬
- 종 목록 작성
○ Mothur와 Qiime2로 혼합어란의 HTS 원시자료 재분석
○ 혼합어란 DNA 메타바코딩 자료 기반 한반도 연근해 주요 어류의 산란종 목록 작성
- 2문 2강 35목 96과 190속 260종(연체동물 1목 2과 4속 4종 포함)
○ 멸치, 청보리멸, 민어 등의 산란장 지도 작성
- Sponsorship
- 한국해양과학기술원
- Report No.
- BSPE99964-13012-3
- Type
- Report
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