이용자의 목적에 따라 다른 모습을 보이는 GIS(Geographic Information System)는 지리적 실체를 지도제작에 사용하는 도구라고도 하고, 가시화와 프리젠테이션에 사용되는 도구라고도 한다. 하지만 GIS의 핵심 기능은 분석으로 지리적, 생물적, 물리적 현상의 공간 관계, 패턴 및 프로세스 등을 과학적인 수준에서 탐색할 수 있다. 본 논문에서는 GIS의 공간분석 기능을 해양환경 연구분야에 어떻게 적용하고 활용할 수 있는지에 초점을 맞추어, 해양환경 GIS 대상범위를 정의하고 해양환경 GIS 기본공간정보 및 속성 DB 구축방법, 해양환경 GIS 주제도 제작 및 2, 3차원 공간분석 방법 등에 대해 소개하며, 해양환경연구에 GIS 활용 범위를 넓히기 위해서는 보다 차원 높은 공간통계분석과 연계해 심도있는 해양환경의 이해와 환경예측에 활용 할 수 있는 GIS 연구개발이 필요할 것으로 본다.