동해연안역 대기 바이오에로졸의 박테리아 군집구조 분석

Abstract

대기시료의 미생물 종 조성 및 다양성 조사방법에는 크게 두 가지가 있다. 첫 번째는 미생물 배양과정을 거쳐 분석하는 방법으로 조사대상 시료 내에 있는 모든 미생물을 배양할 수 없다는 단점이 있다. 두 번째 방법은 배양과정 없이 직접 미생물의 genomic DNA를 추출한 후, PCR 기법을 활용하여 유전자를 분석하는 것이다. 유전자 분석방법을 활용한 미생물 군집의 다양성 조사는 원핵생물의 경우, 16S rRNA 유전자의 염기서열을 비교․분석한다. 미생물의 16S rRNA 유전자는 PCR 기법을 이용하여 증폭산물을 클로닝 한 후, 유전자 단편을 확보하는 방법이 일반적이다. 이와 같은 방법은 정확한 염기서열 정보를 얻을 수 있는 장점이 있지만, 한 시료에서 확보할 수 있는 염기서열의 수가 제한적이고, 많은 비용과 시간을 필요로 하는 단점이 있다. 따라서 본 연구에서는 미생물 배양과정 및 DNA 추출단계 없이 대기 바이오에어로졸 시료의 filtrate를 유전자 분석실험에 직접 사용하여 대상 유전자를 증폭한 후, 대량의 염기서열 정보를 얻을 수 있는 pyrosequencing 기법을 이용하는 연구방법이 대기 바이오에어로졸의 미생물 군집특성 분석법으로 적용 가능한지의 여부를 조사하였다.