DNAchip을 이용한 해양생물의 종 동정

Abstract

21세기 생명공학시대에 다양한 해양생물이 국가 자원으로 인식되면서 해양생물 다양성에 대한 분명한 식별과 보존, 관리의 필요성이 증대되었다. 都鳴?해양산업 활동이 활발해지면서 외래종 유입에 의한 생물교란 및 생태계파괴 현상이 초래되고 있는 실정이다. 이에 따라 해양환경 및 해양생물다양성을 파악하고 나아가 해양생태계 보존 및 관리 체계가 필요하다.지금까지 생물을 분류함에 있어 형태형질 분석이 주축이 되었고 이것이 계통분류의 근간이 되었다. 해양생물의 경우, 특히 어류의 종 분류 및 계통연구는 지느러미 모양, 비늘, 측선, 골격구조 등과 같은 형태형질 및 체장에 대한 체폭, 체고 등에 대한 비율과 같은 계측 형질 등을 바탕으로 하고 있다. 하지만 근래에는 형태 형질을 이용한 계통 연구에 많은 문제점들이 발견되었다. 이런 형태형질을 이용한 분류체계의 단점을 보완하고자 본 연구는 DNA를 이용한 분자생물학적 기법을 이용하였으며 해양생물종의 분류시 유전자형 분석을 간단하고 신속 정확하게 검사하는 방법으로 DNA칩을 제작하였다. 대상은 동해 울진을 중심으로 국내•외 수산자원 총 10종[절지동물(대게-Chionoecetes opilio, 홍게-Chionoecetes japonica), 연체동물(소라-Batillus cornutus, 납작소라-Pomaulax japonicus, 살오징어-Todarodes pacificus), 어류(고등어-Scomber japonicus, 대서양고등어-Scomber scombrus 대구-Gadus macrocephalus, 쥐치-Stephanolepis cirrhifer, 말쥐치-Thamnaconus modestus)]의 미토콘드리아 DNA의 COI(Cytochrome c Oxidase subunit I)을 분석하고, 상동성 서열분석 결과를 토대로 종 특이적 올리고뉴클레오티드 프로브가 심어진 DNA칩을 제작하여 각 종을 식별하였다.참고문헌Hacia JG., Resequencing and mutational analysis using oligonucleotide microarrays. Nat Genet. Jan; 21(1 suppl): 42-7. 1999이윤호, 정다금, DNA바코드: DNA칩을 이용한 해양무척추동물(극피동물, 환형동물)과 어류의 종구분, Integrative Biosciences, Vol.10 August 2006, Korean Association of Biological Sciences, 51p, 2006